Pixelmator Classic Mac est mis à jour en version 3.1, une version qui amène le support du nouveau Mac Pro, ainsi que, sur cette machine, le support des images 16 bit, ainsi que de nouvelles possibilités d'impression depuis le logiciel, via une boutique partenaire, MILK Print . Le logiciel permet d'effectuer les calculs sur une des deux cartes graphiques du Mac Pro, la seconde servant à l'affichage du rendu.
D'autres nouveautés sont de la partie comme la possibilité d'ajuster la transparence sur plusieurs calques à la fois, une palanquée de nouveaux effets et un support du RAW amélioré.
