Alors que l'iPad Pro de 9,7 pouces arbore les mêmes mensurations que l'iPad Air 2, la nouvelle tablette d'Apple dispose de sa propre ligne d'accessoires dans l'Apple Store en ligne.
En effet, plusieurs détails divergent entre les deux ardoise, rendant la plupart des protections pour iPad Air 2 inadaptées au nouvel iPad Pro.
Les coques protégeant le dos de l'appareil disposent en général d'une ouverture tout juste assez large pour le capteur photo, et cachent ainsi le flash ajouté sous l'APN de la nouvelle tablette. De plus, ces protections recouvrent généralement les tranches supérieure et latérales de l'iPad, condamnant ainsi les deux haut-parleurs situés à côté du bouton d'allumage et le nouveau connecteur.
Enfin, l'intégration du Smart Connector a poussé Apple à modifier la position des aimants qui maintiennent les Smart Cover, rendant les protections magnétiques des iPad Air incompatibles avec le nouveau modèle.
